La plateforme Nature en ville a été voulue par le Ministère en charge de l'environnement et le Ministère en charge du logement, et depuis sa création en 2013, le site est animé par Plante & Cité.

La création de la plateforme s'est appuyée sur les actions réalisées dans le cadre du Plan Nature en ville (2010-2013). Ce plan a été mis en oeuvre localement, dans de nombreux projets développés par les collectivités, qu'il s'agisse d'initiatives de préservation, d'intégration aux aménagements urbains voire de renaturation d'espaces ou de démarches plus stratégiques dans une perspective de planification.
Aujourd'hui le site fonctionne comme une plateforme de ressources et de partage d'expériences pour les acteurs de la ville et de l'écologie urbaine (collectivités, entreprises, associations). Une carte interactive des initiatives est disponible.